Pemerintahan

Pemerintah Kabupaten Kepulauan Yapen dipimpin oleh seorang Bupati dan Wakil Bupati yang dipilih langsung oleh rakyat melalui pemilihan kepala Daerah diselenggarakan setiap 5 ( lima ) tahun sekali.

Kabupaten Kepulauan Yapen di tahun 2007 terbagi atas 12 distrik, 5 kelurahan, dan 106 kampung dengan kualifikasi 97 kampung swadaya dan 14 kampung swakarsa untuk jelasnya dapat dilihat pada table berikut :

Tabel Nama Distrik, Jumlah Kampung / Kelurahan, Klasifikasi dan Nama Ibu Kota:

No Nama Distrik Jumlah Kampung Jumlah Kelurahan Klas Swadaya Klas Swakarsa Ibu Kota
1 Yapen Timur 9   6 3 Dawai
2 Yapen  Utara 6   6   Yobi
3 Teluk  Ampimoi 9   9   Randawaya
4 Raimbawi 11   11   Waindu
5 Angkaisera 14   10 4 Menawi
6 Kepulauan  Ambai 10   10   Ambai
7 Yapen  Selatan 10 4 9 5 Serui
8 Kosiwo 10   10   Tatui
9 Yapen Barat 7 1 14   Ansus
10 Wonawa 6   6   Wooi
11 Poom 6   5 1 Poom
12 Windesi 8   8   Windesi
  Jumlah 106 5 98 13